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解決方法：１　doctrine/inflectorをダウングレード
1.3.*にすればいいので、バージョンを指定してダウングレード。
https://www.doctrine-project.org/projects/inflector/1.3.html
下記コマンドで一発。

composer require doctrine/inflector:1.3.1

無事にダウングレードできたら、ログは出なくなった。
EC-CUBEで大量のmethod非推奨ログ「doctrine/inflector」 - Qiita

sudo -u apache bin/console eccube:composer:require doctrine/inflector:1.3.1

秘密鍵ファイルにパスフレーズが設定されているかの確認

$ ssh-keygen -yf ~/.ssh/秘密鍵ファイル名

...
秘密鍵ファイルのパスワードを変更する

$ ssh-keygen -f 秘密鍵ファイル名 -p

sshの秘密鍵パスフレーズの確認と変更 - Qiita